부모를 잃고 마음이 닫힌 채 서니베이 보육원에 들어온 핍과 플로라. 둘은 왓킨스 선생님의 엄격한 규칙들 때문에 답답해하던 중, 홧김에 사고를 치고 보육원에서 도망친다. 와중에 온몸을 보랏빛으로 치장한 한 여자가 거인과 나타나 플로라를 납치하려고 하고, 둘은 숲속을 헤매다 갈라진 주목 나무 사이를 통과해 다른 세계로 넘어온다. 핍과 플로라는 온갖 미지의 생물들 때문에 위험천만한 순간을 거듭 넘기고, 우연히 서니베이 심부름꾼으로 일하던 고르보를 만나 스너그들의 땅으로 향한다. 짤따랗고 땅딸막한 몸집, 파이와 이야기를 좋아하는 유쾌한 성격의 스너그들과 행복한 만찬을 즐기는 것도 잠시! 별안간 보라색 마녀한테 쫓기며 둘은 다시 위험에 빠지는데……. 과연 핍과 플로라는 무사히 집을 찾아 돌아갈 수 있을까?